محققان دانشگاه جورجیا بخشی از یک تیم بین المللی هستند که اولین توالی ژنوم آفتابگردان را منتشر کرده اند. این منبع جدید به برنامه های تحقیقاتی آینده با استفاده از ابزارهای ژنتیکی برای بهبود انعطاف پذیری محصول و تولید روغن کمک خواهد کرد.
تیم تحقیقاتی در آمریکای شمالی و اروپا توالی ژنوم آفتابگردان اهلی Helianthus annuus L را تعیین کردند. آنها همچنین تجزیه و تحلیل های مقایسه ای و ژنومی را انجام دادند که بینش هایی را در مورد تاریخچه تکاملی آستریدها، زیر گروهی از گیاهان گلدار که شامل سیب زمینی، گوجه فرنگی و قهوه.
نقل قول: توالی ژنوم آفتابگردان برای ارائه نقشه راه برای محصولات مقاوم تر (2017، 22 مه) در 1 ژوئیه 2022 از https://phys.org/news/2017-05-sunflower-genome-sequence-roadmap-resilient.html بازیابی شده است.
جان ام. برک استاد بیولوژی گیاهی در دانشگاه جورجیا است. اعتبار: پل افلند/UGA
آفتابگردان که به دلیل زیبایی و همچنین به عنوان منبع مهم غذا شناخته شده است، یک محصول روغنی جهانی است که نویدبخش سازگاری با تغییرات اقلیمی است زیرا می تواند بازدهی پایدار را در طیف گسترده ای از شرایط محیطی از جمله خشکسالی حفظ کند. با این حال، جمع آوری ژنوم آفتابگردان تا همین اواخر دشوار بود، زیرا عمدتاً از توالی های بسیار مشابه و مرتبط تشکیل شده است.
نویسندگان به این نتیجه رسیدند که این تحقیق آفتابگردان را به عنوان مدلی برای مطالعات اکولوژیکی و تکاملی و سازگاری با تغییرات آب و هوایی تقویت می‌کند و برنامه‌های اصلاحی را تسریع می‌کند.
آن ها ژن های کاندید جدیدی را شناسایی کردند و شبکه های ژنتیکی را بازسازی کردند که زمان گلدهی و متابولیسم روغن، دو ویژگی اصلی پرورش آفتابگردان را کنترل می کنند، و دریافتند که شبکه های زمان گلدهی با تکرار کل ژنوم در گذشته شکل گرفته است. یافته‌های آنها نشان می‌دهد که نسخه‌های باستانی ژن‌ها می‌توانند عملکرد خود را حفظ کنند و پس از ده‌ها میلیون سال همچنان بر ویژگی‌های مورد علاقه تأثیر بگذارند.
برک گفت: “این کار ما را برای درک مکانیسم‌های مولکولی زیربنایی ویژگی‌های کلیدی مربوط به مقاومت در برابر تنش غیرزیستی – چیزهایی مانند خشکی، شوری و مقاومت کم مواد مغذی – بسیار تسهیل می‌کند.” این توالی ژنوم اساساً به عنوان یک نقشه راه ژنتیکی برای مشخص کردن ژن‌های زیربنایی این نوع صفات عمل می‌کند.»
سالاد ژن: مجموعه ژنوم کاهو منتشر شد
Hélène Badouin و همکاران، ژنوم آفتابگردان بینشی در مورد متابولیسم روغن، گلدهی و تکامل سیارک ارائه می دهد. طبیعت (2017). DOI: 10.1038/nature22380
ارائه شده توسط دانشگاه جورجیا
این همکاری بین المللی توسط نیکلاس لانگلید در مؤسسه ملی تحقیقات کشاورزی فرانسه در تولوز، فرانسه و شامل لورن ریزبرگ از دانشگاه بریتیش کلمبیا انجام شد.
برک گفت: “مانند بسیاری از ژنوم های گیاهی، ژنوم آفتابگردان بسیار تکراری است، اگرچه در این مورد وضعیت کمی بدتر است.” “عناصر تکراری در ژنوم نسبتاً اخیراً پدید آمده اند، به این معنی که آنها فرصتی برای تمایز ندارند. بنابراین مانند کنار هم قرار دادن یک پازل عظیم است که در آن بسیاری از قطعات دقیقاً یکسان یا تقریباً مشابه به نظر می رسند.”
جان ام. برک، یکی از نویسندگان مقاله، استاد زیست شناسی گیاهی و عضو مرکز گیاهی UGA، گفت: “به عنوان اولین توالی مرجع ژنوم آفتابگردان، این یک موفقیت کامل است.” ژنوم آفتابگردان بیش از 40 درصد بزرگتر از ذرت است [corn] ژنوم، و تقریباً 20 درصد بزرگتر از ژنوم انسان، و ماهیت بسیار تکراری آن، آن را به چالشی منحصر به فرد برای مونتاژ تبدیل کرده است.”
آنها امروز یافته های خود را در مجله منتشر کردند طبیعت.
این برگه یا سند یا نوشته تحت پوشش قانون کپی رایت است. به غیر از هرگونه معامله منصفانه به منظور مطالعه یا تحقیق خصوصی، هیچ بخشی بدون اجازه کتبی قابل تکثیر نیست. محتوای مذکور فقط به هدف اطلاع رسانی ایجاد شده است.